Protein–RNA interactions for Protein: P08923

Ltk, Leukocyte tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtkP08923 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtkP08923 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtkP08923 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtkP08923 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtkP08923 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtkP08923 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtkP08923 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtkP08923 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtkP08923 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtkP08923 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtkP08923 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtkP08923 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtkP08923 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtkP08923 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtkP08923 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtkP08923 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtkP08923 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtkP08923 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtkP08923 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtkP08923 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LtkP08923 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LtkP08923 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtkP08923 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtkP08923 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtkP08923 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LtkP08923 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LtkP08923 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LtkP08923 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LtkP08923 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtkP08923 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtkP08923 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LtkP08923 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtkP08923 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtkP08923 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtkP08923 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtkP08923 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtkP08923 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtkP08923 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtkP08923 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtkP08923 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtkP08923 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtkP08923 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtkP08923 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtkP08923 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtkP08923 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtkP08923 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtkP08923 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtkP08923 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtkP08923 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtkP08923 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtkP08923 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtkP08923 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtkP08923 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtkP08923 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LtkP08923 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtkP08923 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LtkP08923 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtkP08923 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtkP08923 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtkP08923 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtkP08923 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtkP08923 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LtkP08923 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LtkP08923 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LtkP08923 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LtkP08923 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LtkP08923 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LtkP08923 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LtkP08923 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LtkP08923 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LtkP08923 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LtkP08923 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LtkP08923 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LtkP08923 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LtkP08923 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtkP08923 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LtkP08923 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtkP08923 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LtkP08923 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtkP08923 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LtkP08923 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtkP08923 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtkP08923 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtkP08923 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtkP08923 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtkP08923 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtkP08923 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtkP08923 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtkP08923 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LtkP08923 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtkP08923 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtkP08923 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtkP08923 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtkP08923 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtkP08923 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtkP08923 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtkP08923 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtkP08923 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtkP08923 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtkP08923 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms