Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NefmP08553 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NefmP08553 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NefmP08553 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NefmP08553 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NefmP08553 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NefmP08553 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NefmP08553 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NefmP08553 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NefmP08553 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NefmP08553 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NefmP08553 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NefmP08553 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NefmP08553 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NefmP08553 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NefmP08553 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NefmP08553 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NefmP08553 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NefmP08553 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NefmP08553 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NefmP08553 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NefmP08553 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NefmP08553 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NefmP08553 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NefmP08553 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NefmP08553 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NefmP08553 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NefmP08553 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NefmP08553 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NefmP08553 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NefmP08553 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NefmP08553 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NefmP08553 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NefmP08553 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NefmP08553 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NefmP08553 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NefmP08553 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NefmP08553 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NefmP08553 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NefmP08553 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NefmP08553 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NefmP08553 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NefmP08553 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NefmP08553 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NefmP08553 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NefmP08553 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NefmP08553 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NefmP08553 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NefmP08553 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NefmP08553 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NefmP08553 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NefmP08553 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NefmP08553 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NefmP08553 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NefmP08553 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NefmP08553 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NefmP08553 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NefmP08553 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NefmP08553 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NefmP08553 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NefmP08553 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NefmP08553 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NefmP08553 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NefmP08553 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NefmP08553 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NefmP08553 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NefmP08553 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NefmP08553 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NefmP08553 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NefmP08553 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NefmP08553 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NefmP08553 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NefmP08553 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NefmP08553 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NefmP08553 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NefmP08553 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NefmP08553 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NefmP08553 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NefmP08553 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NefmP08553 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NefmP08553 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NefmP08553 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NefmP08553 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NefmP08553 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NefmP08553 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NefmP08553 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NefmP08553 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NefmP08553 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NefmP08553 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NefmP08553 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NefmP08553 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NefmP08553 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NefmP08553 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NefmP08553 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NefmP08553 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NefmP08553 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NefmP08553 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NefmP08553 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NefmP08553 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NefmP08553 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms