Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spta1P08032 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spta1P08032 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spta1P08032 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spta1P08032 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spta1P08032 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spta1P08032 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Spta1P08032 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spta1P08032 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms