Protein–RNA interactions for Protein: P04942

Ig kappa chain V-VI region NQ5-61.1.2, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04942 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04942 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P04942 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P04942 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04942 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P04942 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04942 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P04942 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P04942 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04942 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04942 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04942 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04942 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04942 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P04942 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04942 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04942 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04942 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04942 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04942 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04942 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04942 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P04942 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04942 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04942 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04942 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P04942 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04942 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04942 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04942 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04942 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04942 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04942 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04942 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04942 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04942 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04942 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04942 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04942 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04942 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04942 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04942 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04942 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04942 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04942 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04942 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04942 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04942 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04942 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04942 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04942 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04942 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P04942 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P04942 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04942 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04942 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P04942 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04942 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04942 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P04942 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P04942 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04942 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04942 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04942 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04942 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04942 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04942 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04942 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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P04942 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04942 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04942 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04942 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04942 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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P04942 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04942 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04942 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04942 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04942 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04942 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04942 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04942 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04942 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04942 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04942 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04942 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04942 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04942 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04942 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04942 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04942 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04942 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04942 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P04942 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04942 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04942 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04942 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04942 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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