Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Ab1P01921 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms