Protein–RNA interactions for Protein: P01897

H2-L, H-2 class I histocompatibility antigen, L-D alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-LP01897 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-LP01897 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-LP01897 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-LP01897 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-LP01897 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-LP01897 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-LP01897 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-LP01897 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-LP01897 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-LP01897 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-LP01897 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-LP01897 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-LP01897 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms