Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01800 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01800 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01800 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01800 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01800 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01800 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01800 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01800 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01800 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01800 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01800 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01800 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01800 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01800 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01800 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01800 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01800 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01800 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01800 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01800 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01800 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01800 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01800 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01800 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01800 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01800 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01800 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01800 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01800 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01800 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01800 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01800 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01800 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01800 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01800 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01800 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01800 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01800 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01800 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01800 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01800 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01800 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01800 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01800 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01800 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01800 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01800 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01800 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01800 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01800 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01800 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01800 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01800 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01800 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01800 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01800 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01800 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01800 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01800 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01800 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01800 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01800 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01800 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01800 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01800 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01800 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01800 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01800 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01800 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01800 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01800 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01800 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01800 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01800 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01800 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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