Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01797 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01797 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01797 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01797 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01797 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01797 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01797 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01797 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01797 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01797 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01797 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01797 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01797 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01797 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01797 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01797 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01797 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01797 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01797 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01797 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01797 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01797 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01797 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01797 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01797 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01797 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01797 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01797 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01797 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01797 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01797 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01797 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01797 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01797 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01797 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01797 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01797 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01797 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01797 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01797 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01797 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01797 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01797 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01797 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01797 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01797 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01797 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms