Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01660 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01660 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01660 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01660 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01660 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01660 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01660 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01660 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01660 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01660 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01660 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01660 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01660 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01660 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01660 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01660 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01660 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01660 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01660 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01660 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01660 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01660 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01660 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01660 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01660 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01660 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01660 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01660 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01660 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01660 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01660 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01660 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01660 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01660 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01660 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01660 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01660 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01660 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01660 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01660 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01660 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01660 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01660 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01660 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01660 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01660 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01660 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01660 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01660 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01660 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01660 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01660 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01660 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01660 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01660 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01660 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01660 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01660 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01660 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01660 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01660 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01660 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01660 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01660 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01660 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01660 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01660 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01660 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01660 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01660 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01660 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01660 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01660 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01660 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01660 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01660 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01660 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01660 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01660 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01660 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01660 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01660 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01660 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01660 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01660 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01660 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01660 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01660 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01660 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01660 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01660 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01660 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01660 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01660 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01660 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01660 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01660 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01660 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01660 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms