Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01658 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01658 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01658 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01658 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01658 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01658 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01658 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01658 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01658 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01658 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01658 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01658 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01658 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01658 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01658 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01658 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01658 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01658 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01658 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01658 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01658 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01658 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01658 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01658 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01658 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01658 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01658 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01658 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01658 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01658 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01658 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01658 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01658 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01658 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01658 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01658 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01658 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01658 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01658 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01658 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01658 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01658 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01658 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01658 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01658 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01658 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01658 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01658 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01658 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01658 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01658 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01658 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01658 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01658 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01658 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01658 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01658 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01658 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01658 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01658 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01658 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
P01658 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01658 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01658 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01658 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01658 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01658 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01658 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01658 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01658 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01658 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01658 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01658 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01658 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01658 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01658 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01658 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01658 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01658 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01658 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01658 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01658 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01658 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01658 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01658 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01658 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01658 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01658 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01658 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01658 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01658 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01658 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01658 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01658 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01658 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01658 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01658 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01658 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01658 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms