Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01649 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01649 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01649 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01649 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01649 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01649 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01649 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01649 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01649 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01649 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01649 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01649 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01649 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01649 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01649 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01649 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01649 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01649 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01649 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01649 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01649 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01649 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01649 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01649 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01649 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01649 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01649 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01649 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01649 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01649 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01649 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01649 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01649 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01649 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01649 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01649 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01649 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01649 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01649 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01649 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01649 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01649 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01649 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01649 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01649 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01649 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01649 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01649 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01649 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01649 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01649 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01649 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01649 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01649 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01649 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01649 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01649 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01649 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01649 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01649 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01649 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01649 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01649 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01649 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01649 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01649 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01649 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01649 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01649 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01649 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01649 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
P01649 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01649 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01649 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01649 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01649 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01649 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01649 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01649 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01649 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01649 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms