Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01641 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01641 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01641 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01641 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01641 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01641 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01641 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
P01641 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01641 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01641 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01641 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01641 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01641 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01641 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01641 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01641 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01641 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01641 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01641 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01641 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01641 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01641 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01641 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01641 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01641 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01641 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01641 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01641 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01641 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01641 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01641 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
P01641 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01641 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01641 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01641 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01641 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
P01641 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01641 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01641 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01641 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01641 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01641 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01641 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
P01641 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01641 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01641 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01641 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01641 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01641 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01641 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01641 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01641 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01641 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01641 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01641 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01641 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01641 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01641 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01641 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01641 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01641 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01641 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01641 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01641 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01641 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01641 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01641 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01641 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01641 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01641 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01641 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01641 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
P01641 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01641 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01641 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
P01641 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01641 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01641 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01641 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01641 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01641 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01641 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01641 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01641 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01641 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01641 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01641 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P01641 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01641 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01641 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01641 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01641 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01641 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01641 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01641 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01641 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01641 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01641 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01641 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms