Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01638 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01638 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01638 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01638 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01638 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01638 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01638 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01638 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01638 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01638 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01638 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01638 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01638 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01638 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01638 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01638 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01638 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01638 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01638 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01638 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01638 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01638 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01638 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01638 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01638 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01638 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01638 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01638 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01638 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01638 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01638 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01638 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01638 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01638 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01638 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01638 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01638 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01638 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01638 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01638 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01638 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01638 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01638 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01638 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01638 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01638 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01638 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01638 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01638 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01638 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01638 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01638 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01638 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01638 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01638 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01638 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01638 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01638 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01638 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01638 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01638 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01638 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01638 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01638 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01638 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01638 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01638 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01638 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01638 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01638 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01638 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01638 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01638 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01638 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01638 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01638 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01638 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01638 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01638 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01638 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01638 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01638 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01638 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01638 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01638 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01638 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01638 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01638 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01638 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01638 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01638 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01638 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01638 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01638 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01638 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01638 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01638 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01638 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01638 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms