Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MscO88940 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MscO88940 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MscO88940 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MscO88940 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MscO88940 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MscO88940 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MscO88940 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MscO88940 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MscO88940 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MscO88940 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MscO88940 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MscO88940 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MscO88940 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MscO88940 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MscO88940 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MscO88940 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MscO88940 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MscO88940 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MscO88940 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MscO88940 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MscO88940 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MscO88940 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MscO88940 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MscO88940 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MscO88940 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MscO88940 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MscO88940 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MscO88940 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MscO88940 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MscO88940 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MscO88940 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MscO88940 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MscO88940 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MscO88940 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MscO88940 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MscO88940 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MscO88940 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MscO88940 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MscO88940 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MscO88940 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MscO88940 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MscO88940 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MscO88940 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MscO88940 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MscO88940 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MscO88940 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MscO88940 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MscO88940 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MscO88940 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MscO88940 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MscO88940 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MscO88940 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MscO88940 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MscO88940 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MscO88940 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MscO88940 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MscO88940 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MscO88940 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MscO88940 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MscO88940 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MscO88940 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MscO88940 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MscO88940 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MscO88940 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MscO88940 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MscO88940 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MscO88940 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MscO88940 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MscO88940 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MscO88940 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MscO88940 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MscO88940 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MscO88940 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms