Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnkO88874 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnkO88874 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnkO88874 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnkO88874 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnkO88874 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnkO88874 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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