Protein–RNA interactions for Protein: O88822

Sc5d, Lathosterol oxidase, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sc5dO88822 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sc5dO88822 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sc5dO88822 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sc5dO88822 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sc5dO88822 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sc5dO88822 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sc5dO88822 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sc5dO88822 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sc5dO88822 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sc5dO88822 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sc5dO88822 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sc5dO88822 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sc5dO88822 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sc5dO88822 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sc5dO88822 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sc5dO88822 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sc5dO88822 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sc5dO88822 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sc5dO88822 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sc5dO88822 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sc5dO88822 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms