Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dll3O88516 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dll3O88516 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dll3O88516 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dll3O88516 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dll3O88516 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dll3O88516 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dll3O88516 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dll3O88516 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms