Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt1O88346 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms