Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nid2O88322 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nid2O88322 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nid2O88322 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nid2O88322 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nid2O88322 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nid2O88322 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nid2O88322 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nid2O88322 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nid2O88322 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nid2O88322 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nid2O88322 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms