Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Srpk1O70551 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srpk1O70551 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms