Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtssO70370 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtssO70370 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtssO70370 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtssO70370 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtssO70370 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtssO70370 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtssO70370 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtssO70370 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtssO70370 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtssO70370 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtssO70370 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtssO70370 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtssO70370 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtssO70370 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtssO70370 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtssO70370 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtssO70370 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtssO70370 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtssO70370 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtssO70370 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtssO70370 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtssO70370 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtssO70370 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CtssO70370 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtssO70370 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtssO70370 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtssO70370 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtssO70370 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CtssO70370 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtssO70370 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtssO70370 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtssO70370 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtssO70370 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtssO70370 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtssO70370 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtssO70370 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtssO70370 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CtssO70370 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtssO70370 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtssO70370 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtssO70370 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtssO70370 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CtssO70370 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtssO70370 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtssO70370 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtssO70370 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtssO70370 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtssO70370 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtssO70370 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtssO70370 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtssO70370 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtssO70370 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CtssO70370 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtssO70370 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtssO70370 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtssO70370 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtssO70370 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtssO70370 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtssO70370 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtssO70370 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtssO70370 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtssO70370 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtssO70370 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtssO70370 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtssO70370 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtssO70370 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtssO70370 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtssO70370 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CtssO70370 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtssO70370 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtssO70370 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtssO70370 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtssO70370 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtssO70370 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtssO70370 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtssO70370 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms