Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lnx1O70263 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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