Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx4O55187 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx4O55187 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms