Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrxO55103 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PrxO55103 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrxO55103 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrxO55103 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrxO55103 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrxO55103 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrxO55103 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrxO55103 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrxO55103 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrxO55103 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrxO55103 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrxO55103 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrxO55103 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrxO55103 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrxO55103 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PrxO55103 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrxO55103 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrxO55103 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrxO55103 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PrxO55103 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrxO55103 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrxO55103 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrxO55103 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PrxO55103 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PrxO55103 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PrxO55103 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PrxO55103 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PrxO55103 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PrxO55103 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrxO55103 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrxO55103 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrxO55103 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrxO55103 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrxO55103 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrxO55103 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrxO55103 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrxO55103 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrxO55103 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrxO55103 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrxO55103 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PrxO55103 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrxO55103 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrxO55103 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrxO55103 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrxO55103 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrxO55103 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PrxO55103 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrxO55103 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrxO55103 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrxO55103 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrxO55103 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrxO55103 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrxO55103 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrxO55103 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrxO55103 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrxO55103 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrxO55103 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PrxO55103 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrxO55103 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrxO55103 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrxO55103 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrxO55103 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrxO55103 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrxO55103 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrxO55103 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrxO55103 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PrxO55103 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PrxO55103 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrxO55103 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrxO55103 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrxO55103 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrxO55103 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrxO55103 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PrxO55103 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrxO55103 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PrxO55103 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrxO55103 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrxO55103 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrxO55103 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrxO55103 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrxO55103 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PrxO55103 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrxO55103 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrxO55103 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrxO55103 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrxO55103 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrxO55103 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrxO55103 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrxO55103 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrxO55103 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrxO55103 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrxO55103 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrxO55103 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrxO55103 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrxO55103 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrxO55103 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrxO55103 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrxO55103 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrxO55103 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms