Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema6bO54951 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms