Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms