Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limk2O54785 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limk2O54785 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Limk2O54785 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Limk2O54785 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limk2O54785 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Limk2O54785 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limk2O54785 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limk2O54785 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limk2O54785 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limk2O54785 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms