Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms