Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emp3O35912 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Emp3O35912 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emp3O35912 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emp3O35912 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Emp3O35912 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emp3O35912 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Emp3O35912 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Emp3O35912 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emp3O35912 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emp3O35912 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Emp3O35912 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emp3O35912 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emp3O35912 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emp3O35912 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Emp3O35912 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms