Protein–RNA interactions for Protein: O35716

Socs1, Suppressor of cytokine signaling 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs1O35716 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs1O35716 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs1O35716 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs1O35716 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs1O35716 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs1O35716 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs1O35716 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Socs1O35716 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Socs1O35716 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Socs1O35716 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Socs1O35716 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Socs1O35716 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms