Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnnO35691 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnnO35691 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnnO35691 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnnO35691 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnnO35691 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnnO35691 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnnO35691 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnnO35691 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnnO35691 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnnO35691 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnnO35691 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnnO35691 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnnO35691 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnnO35691 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnnO35691 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnnO35691 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnnO35691 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PnnO35691 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnnO35691 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnnO35691 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnnO35691 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnnO35691 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnnO35691 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnnO35691 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnnO35691 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnnO35691 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnnO35691 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnnO35691 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnnO35691 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PnnO35691 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PnnO35691 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PnnO35691 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PnnO35691 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PnnO35691 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PnnO35691 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PnnO35691 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PnnO35691 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PnnO35691 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PnnO35691 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PnnO35691 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PnnO35691 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PnnO35691 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PnnO35691 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PnnO35691 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PnnO35691 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PnnO35691 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PnnO35691 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PnnO35691 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PnnO35691 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PnnO35691 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PnnO35691 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PnnO35691 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PnnO35691 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PnnO35691 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PnnO35691 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PnnO35691 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PnnO35691 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PnnO35691 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PnnO35691 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PnnO35691 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PnnO35691 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PnnO35691 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PnnO35691 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PnnO35691 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PnnO35691 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PnnO35691 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PnnO35691 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PnnO35691 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PnnO35691 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PnnO35691 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PnnO35691 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PnnO35691 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PnnO35691 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PnnO35691 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PnnO35691 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PnnO35691 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PnnO35691 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PnnO35691 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PnnO35691 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnnO35691 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnnO35691 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnnO35691 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnnO35691 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnnO35691 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PnnO35691 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnnO35691 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnnO35691 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnnO35691 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnnO35691 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PnnO35691 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PnnO35691 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PnnO35691 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PnnO35691 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PnnO35691 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PnnO35691 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PnnO35691 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PnnO35691 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PnnO35691 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PnnO35691 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms