Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phox2bO35690 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Phox2bO35690 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phox2bO35690 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phox2bO35690 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phox2bO35690 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phox2bO35690 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms