Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NudcO35685 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NudcO35685 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NudcO35685 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NudcO35685 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NudcO35685 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NudcO35685 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NudcO35685 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NudcO35685 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NudcO35685 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NudcO35685 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NudcO35685 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NudcO35685 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NudcO35685 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NudcO35685 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NudcO35685 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NudcO35685 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NudcO35685 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NudcO35685 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NudcO35685 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NudcO35685 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NudcO35685 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NudcO35685 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NudcO35685 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NudcO35685 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NudcO35685 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NudcO35685 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NudcO35685 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NudcO35685 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NudcO35685 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NudcO35685 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NudcO35685 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NudcO35685 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NudcO35685 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NudcO35685 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NudcO35685 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NudcO35685 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NudcO35685 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NudcO35685 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NudcO35685 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NudcO35685 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NudcO35685 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NudcO35685 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NudcO35685 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NudcO35685 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NudcO35685 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NudcO35685 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NudcO35685 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NudcO35685 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NudcO35685 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NudcO35685 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NudcO35685 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NudcO35685 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NudcO35685 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NudcO35685 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NudcO35685 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NudcO35685 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NudcO35685 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NudcO35685 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NudcO35685 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NudcO35685 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NudcO35685 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NudcO35685 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NudcO35685 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NudcO35685 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NudcO35685 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NudcO35685 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NudcO35685 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NudcO35685 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NudcO35685 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NudcO35685 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NudcO35685 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NudcO35685 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NudcO35685 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NudcO35685 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NudcO35685 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NudcO35685 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NudcO35685 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NudcO35685 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NudcO35685 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NudcO35685 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NudcO35685 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NudcO35685 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NudcO35685 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NudcO35685 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NudcO35685 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NudcO35685 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NudcO35685 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NudcO35685 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NudcO35685 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NudcO35685 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NudcO35685 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NudcO35685 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NudcO35685 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NudcO35685 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NudcO35685 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NudcO35685 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NudcO35685 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NudcO35685 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NudcO35685 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms