Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn1mwO35599 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms