Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Atf6bO35451 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Atf6bO35451 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Atf6bO35451 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Atf6bO35451 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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