Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema3aO08665 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms