Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec22bO08547 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms