Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20939L7N243 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20939L7N243 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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