Protein–RNA interactions for Protein: K7N5P2

Gm3402, Predicted gene 3402, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3402K7N5P2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3402K7N5P2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3402K7N5P2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms