Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2056J3QQ02 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2056J3QQ02 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms