Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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