Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a18J3QN01 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ms4a18J3QN01 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ms4a18J3QN01 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ms4a18J3QN01 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ms4a18J3QN01 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a18J3QN01 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms