Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3727J3QM54 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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