Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21411J3KMS0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms