Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21897J3KMP5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21897J3KMP5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms