Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pot1bH7BX60 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms