Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn20G5E8X0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn20G5E8X0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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