Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp17lcG5E8I7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Usp17lcG5E8I7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
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Usp17lcG5E8I7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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