Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r12G5E8G1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms