Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r67G5E8C1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms